1997年11月11日，李鹏总理访日，提出发展中日关系五原则“相互尊重，互不干涉内政；求同存异，妥善处理分歧；加强对话，增进了解；互惠互利，深化经济合作；面向未来，实现世代友好。同日，中日两国政府签署渔业协定。
1998年4月21日，胡锦涛副主席访日，强调发展中日关系要以史为鉴，面向未来。
1998年11月25日，江泽民主席对日本进行正式访问，这是中国国家元首首次访问日本，双方发表中日联合宣言，宣布两国建立“致力于和平与发展的友好合作伙伴关系”。
1999年7月8日，小渊惠三首相正式访华。
1999年12月8日，中共中央政治局常委、全国政协主席李瑞环对日进行正式友好访问。
【二十一世纪】
2000年4月4日，中共中央政治局候补委员、中央书记处书记兼中组部部长曾庆红同志率中国共产党代表团对日本进行友好访问。
2000年5月10日，唐家璇外长正式访日。
2000年5月20日，江泽民主席会见5000多名日本各界组成的日中文化观光交流使节团，就发展民间友好发表重要讲话。
2000年5月29日，日本执政三党干事长访华。
2000年6月7日，钱其琛副总理作为中国政府特使赴日本出席日本政府为小渊惠三前首相举行的葬礼。
2000年8月28日，日本外务大臣河野洋平应邀对中国进行正式访问。
2000年10月12日，朱镕基总理正式访日。
2001年4月3日，日本文部科学省宣布通过右翼炮制的历史教科书，中方提出强烈抗议，要求日本政府纠正错误。
2001年4月20日，日本政府允许李登辉以治病为名赴日。中方提出严正交涉，采取冻结中日高层往来、军舰访日、安全对话等措施。
2001年7月9日，日本执政三党干事长访华。
2001年8月13日，日本首相小泉纯一郎参拜靖国神社。
2001年10月8日，日本首相小泉纯一郎对华进行工作访问，参观卢沟桥抗战纪念馆，对日本侵华历史表示反省和道歉。
2001年10月21日，江泽民主席会见出席上海APEC会议的日本首相小泉纯一郎。
2001年11月5日，中日韩三国领导人在文莱10+3会议期间举行会晤，朱镕基总理和日本首相小泉纯一郎出席。
2001年12月21日，中日双方就解决大葱、香菇、蔺草席三种农产品贸易争端达成共识，日方决定不启动正式保障措施，中方撤消特别关税报复措施。
2001年12月22日，日本海上保安厅巡视船追逐一艘不明国籍船只进入我专属经济区水域，双方发生交火，不明国籍船只沉没。中方对日本在东海海域使用武力表示不满。
2002年4月2日至9日，李鹏委员长对日本进行正式友好访问，并与日本首相小泉纯一郎共同出席纪念中日邦交正常化30周年“中国文化年”、“日本文化年”开幕式。
2002年4月12日，朱镕基总理会见出席博鳌论坛首届年会的日本首相小泉纯一郎。
2002年4月21日，日本首相小泉纯一郎再次参拜靖国神社。中方提出严正交涉，并推迟日本防卫厅长官中谷元访华及我海军舰艇编队访日。
2002年4月25日至28日，中共中央政治局候补委员、书记处书记曾庆红访问日本大分县。
2002年5月8日，以全国政协副主席胡启立为名誉团长的中国5000人旅游交流团访日。
2002年5月8日，5名偷渡来华的朝鲜人冲闯日本驻沈阳总领馆。我武警经日方同意后，进入日总领馆将2名非法闯入者带出。日方诬我武警违反国际法并作出强烈反应。我及时公布事实真相予以批驳。22日，我将5名涉案人员遣送第三国。
2002年6月18日，在日方承认中方对本国专属经济区拥有主权权利和管辖权，并依法履行必要程序后，中方批准日方打捞东海沉船。
2002年6月19日，唐家璇外长在泰国出席ACD外长非正式会议期间与日本外相川口顺子举行会晤。
2002年7月30日，唐家璇外长在文莱出席10+3会议期间会见日本外相川口顺子。
2002年9月8日至10日，日本外相川口顺子访华，江泽民主席、钱其琛副总理分别会见。
2002年9月14日，日方结束东海沉船打捞作业。
2002年9月22日，江泽民主席出席纪念中日邦交正常化30周年友好交流大会，并发表重要讲话。日本83名国会议员和各界人士1万3千余人来华参加大会。
2002年9月22日，朱镕基总理在丹麦出席第四届亚欧首脑会议期间会见日本首相小泉纯一郎。
2002年10月27日，江泽民主席在墨西哥出席APEC第十次领导人非正式会议期间会见日本首相小泉纯一郎。
2002年11月4日，朱镕基总理在金边出席10+3领导人会议期间，主持同日本首相小泉纯一郎、韩国总理金硕洙的中日韩领导人会晤。
2002年12月4日、24日和2003年2月28日，唐家璇外长与日本外相川口顺子通电话，就中日关系等交换意见。
2003年1月4日，日本媒体披露日本政府从所谓“民间所有者”手中租借钓鱼岛，中方向日本政府提出严正交涉。
2003年1月14日，日本首相小泉纯一郎再次参拜靖国神社，中方提出严正交涉。
2003年4月6日至8日，日本外相川口顺子访华，温家宝总理、唐家璇国务委员分别会见。
2003年5月18日至20日，日本联合执政的自民党、公明党、保守新党干事长访华，胡锦涛主席、黄菊副总理、唐家璇国务委员分别会见。
2003年5月31日，胡锦涛主席在圣彼得堡出席建城300周年庆典期间会见日本首相小泉纯一郎。
2003年8月4日，黑龙江省齐齐哈尔市发生侵华日军遗弃化学毒剂伤人事件，造成我重大人员伤亡。
2003年8月9日至11日，日本内阁官房长官福田康夫访华。
2003年8月10日至13日，李肇星外长访问日本。
2003年9月1日至4日，日本防卫厅长官石破茂访华。
2003年9月4日至10日，吴邦国委员长对日本进行正式友好访问。
2003年10月7日，温家宝总理在印度尼西亚巴厘岛出席第七次东盟与中日韩（10＋3）领导人会议期间会见日本首相小泉纯一郎。
2003年10月20日，胡锦涛主席在泰国曼谷出席第11次亚太经济合作组织领导人非正式会议期间会见日本首相小泉纯一郎。
2004年4月3日至4日，日本外相川口顺子访华。
2004年9月12日，唐家璇国务委员在会见来华出席“2004中国企业峰会”的日本外相川口顺子。
2004年9月20日至25日，日本众议院议长河野洋平率团访华。胡锦涛主席、吴邦国委员长、曾庆红副主席分别会见。
2004年10月9日，李肇星外长在越南河内会见日本外相町村信孝。
2004年10月21日、24日，温家宝总理分别就日本受台风袭击和新泻县地震向日本首相小泉纯一郎致慰问电。
2004年10月25日，中日第一轮东海磋商在北京举行。
2004年10月28日，中国红十字会通过日本红十字会向日本新泻地震灾区提供10万美元的救灾援款。
2004年11月18日，李肇星外长在智利圣地亚哥出席亚太经合组织部长级会议期间会见日本外相町村信孝。
2004年11月22日，胡锦涛主席在智利圣地亚哥会见日本首相小泉纯一郎。
2004年11月30日，温家宝总理在老挝万象出席第八次东盟与中日韩（10＋3）领导人会议期间会见日本首相小泉纯一郎。
2004年12月22日，日本政府为李登辉赴日活动发放签证。中方提出严正交涉和强烈抗议。
2005年4月13日至20日，全国人大常委会副委员长路甬祥率全国人大代表团访问日本并出席各国议会联盟“东盟+中日韩三国小组会议”及全国人大和日本众议院合作委员会首次会议。
2005年4月17日至18日，日本外相町村信孝正式访华。
2005年4月23日，胡锦涛主席出席在印尼雅加达举行的亚非峰会时会见小泉首相，就发展中日关系提出5点主张。即：严格遵守《中日联合声明》等三个政治文件；坚持以史为鉴、面向未来；正确处理好台湾问题；坚持通过对话，平等协商，妥善处理中日之间的分歧；进一步加强在广泛领域的交流和合作，进一步加强民间友好往来，以增进相互了解，扩大共同利益，使中日关系健康稳定地向前发展。
2005年5月7日，李肇星外长在日本京都与日本外相町村信孝和韩国外交通商部长官潘基文举行中日韩三方委员会第三次会议。
2005年5月14日，中日第一次战略对话在北京举行。
2005年5月17日至23日，吴仪副总理赴日本出席爱知世博会中国馆日活动并顺访日本。
2005年5月21日，唐家璇国务委员会见日本自民党干事长武部勤和公明党干事长冬柴铁三一行。
2005年5月22日，胡锦涛主席会见日本自民党干事长武部勤和公明党干事长冬柴铁三一行。
2005年5月27日，李肇星外长在老挝首都万象出席东盟与中日韩外长会议。
2005年5月30日至31日，中日第二轮东海磋商在北京举行。
2005年6月23日至24日，中日第二次战略对话在东京举行。
2005年9月3日，胡锦涛主席出席纪念中国人民抗日战争暨世界反法西斯战争胜利60周年大会时发表重要讲话，其中全面阐述中国政府致力于发展中日关系的政策主张。
2005年9月30日至10月1日，中日第三轮东海磋商在东京举行。
2005年10月14日至17日，中日第三次战略对话在北京举行。
2005年10月17日，日本首相小泉纯一郎第五次参拜靖国神社，中方提出严正交涉。
2006年2月10日至11日，中日第四次战略对话在东京举行。
2006年2月21日至22日，“中日执政党交流机制”第一次会议在北京举行。
2006年3月6日至7日，中日第四轮东海磋商在北京举行。
2006年3月31日，胡锦涛主席会见日本日中友好七团体，就发展中日关系发表重要讲话。
2006年5月7日至9日，中日第五次战略对话在北京和贵州举行。
2006年5月18日，中日第五轮东海磋商在东京举行。
2006年5月23日，李肇星外长在多哈出席亚洲合作对话第五次外长会议期间会见日本外相麻生太郎。
2006年7月4日，胡锦涛主席会见来访的日本民主党党首小泽一郎。
2006年7月8日至9日，中日第六轮东海磋商在北京举行。
2006年7月27日，李肇星外长出席马来西亚首都吉隆坡东盟地区论坛外长会议期间与麻生外相再次举行会晤。
2006年8月15日，日本首相小泉纯一郎无视国际社会、亚洲邻国和日本人民的关切和反对，公然参拜靖国神社。中方提出严正交涉。
（三）中日关系近况
近年来，中日关系出现了邦交正常化以来前所未有的复杂局面。一方面，两国经贸合作继续发展，相互依存不断加深；另一方面，日本领导人坚持参拜靖国神社成为影响两国关系发展的症结问题，中日高层互访已中断五年，两国国民感情明显下滑。
今年8月15日，日本首相小泉纯一郎无视国际社会、亚洲邻国和日本人民的关切和反对，第六次公然参拜靖国神社，再次给中日关系带来严重干扰。
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